Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms