Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aqp4P55088 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aqp4P55088 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms