Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms