Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms