Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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