Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms