Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CntfP51642 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntfP51642 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntfP51642 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfP51642 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntfP51642 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntfP51642 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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