Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt2P50752 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms