Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms