Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FmodP50608 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FmodP50608 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FmodP50608 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FmodP50608 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms