Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpbP50405 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SftpbP50405 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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