Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms