Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CitP49025 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CitP49025 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CitP49025 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CitP49025 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms