Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VdrP48281 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VdrP48281 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms