Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms