Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gli1P47806 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms