Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo1bP46735 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo1bP46735 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms