Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sipa1P46062 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms