Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtgfrP43117 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms