Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf7P43029 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms