Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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