Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbP41155 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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