Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TfamP40630 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TfamP40630 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms