Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms