Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtlP38585 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtlP38585 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtlP38585 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms