Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms