Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms