Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RetP35546 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RetP35546 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RetP35546 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RetP35546 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RetP35546 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms