Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms