Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms