Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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