Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch4P31695 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch4P31695 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms