Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxraP28700 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxraP28700 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxraP28700 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxraP28700 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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