Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apex1P28352 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apex1P28352 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apex1P28352 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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