Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa2P28309 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms