Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CftrP26361 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CftrP26361 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CftrP26361 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CftrP26361 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CftrP26361 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CftrP26361 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms