Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms