Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh1a1P24549 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms