Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms