Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms