Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms