Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ggta1P23336 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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