Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms