Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpcP21841 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpcP21841 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpcP21841 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms