Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcb1aP21447 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.1 ms