Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms