Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SagP20443 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms