Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gata1P17679 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms