Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmga1P17095 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms