Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms